urgente: aviso de baja laboral a la empresa

Hola, buenos dias, tengo una duda sobre las bajas laborales y la comunicacion a la empresa.
Mi situacion es la siguiente: Denuncie a la empresa porque no me paga unos pluses que pone en el convenio, tras todo esto y desde hace unos meses tengo discusiones con mi jefe (llamemos discusion a que mi jefe me grita y yo me defiendo) ya que me esta exigiendo trabajos que no tengo porque hacer, me pone faltas a todo lo que hago, etc. Estas discusiones se agravan dia a dia, hasta el punto que me han suspendido de empleo y sueldo durante 15 dias...por supuesto lo voy a denunciar ya que todo es mentira y lo puedo demostrar.
El caso es que van a por mi.
Estos dias estoy teniendo ansiedad, no puedo dormir, me duele el pecho, vamos que estoy fatal a medida que se hacerca la fecha de reincorporacion...he ido al medico y al ver mi situacion y estado me ha dicho que me va a dar la baja pero teno que esperar al dia que este de alta en el trabajo de nuevo ya que ahora no puede por estar suspendido de empleo y sueldo.
El dia de la reincorporacion tengo cita con el medico para darme la baja y mi pregunta es ¿ese dia no voy al trabajo, me da la baja y se la envio a la empresa? ¿se puede hacer asi? ¿es correcto? ¿no tengo que comuniar antes nada, no?... es que ellos van a buscar cualquier excusa para echarme..
Es que encima de ser un trabajador que desde 11 años no he tenido ninguna baja, he sido un buen trabajador y todo se ha torcido desde la denuncia, no quiero encima "avisar" y ser una "buena persona" (que ademas los soy)... no se si me entendeis....
Espero vuestra respuesta y de antemano muchas gracias a todos.